EI CiiMaR-GoMC se constituye por instituciones académicas y de investigación de educación superior de México e internacionales de Estados Unidos de América, Cuba y otras organizaciones internacionales interesadas, que llevan a cabo proyectos enfocados a la investigación marina y costera en el Golfo de México y del Caribe. El CiiMAR-GoMC cuenta con un órgano de gobierno, al Consejo de Rectores, integrado por los titulares de las instituciones miembros.